跟FUT相比，FUE逐一提取毛囊的方式是两种植发技术的较大区别，微创伤口也使得fue是现在较受欢迎的植发方式。而这些进步的一大原因是器械的改变——植发种植笔。
植发步骤图示
植发种植笔是一个长得像笔一样的器械，特点是笔尖中空连接着装有毛囊的管状装置。使用植发笔种植之前，医生会先将几个毛囊单位装载到植发笔中。具体步骤是用镊子夹住毛囊的上部，轻轻放入空心的管状装置里，然后装载到植发笔里。接下来，医生通过将针尖以适当的角度插入头皮，然后按压植发笔的上端植入毛囊。这个步骤跟订书机的原理相似，装订书针，然后按压。目前，fue植发技术中有几种不同类型的植发笔，但是他们的原理都是相同的。
Choi Implanter
Choi Implanter通常被认为是“原始”植入笔设备，起源于韩国。初代植发笔的原理比较简单：把切口和植入毛囊的步骤结合起来。通常情况下，2-6个植发笔同时使用，而且植发笔有很多不同类型的针头，已匹配不同发根数量的毛囊。
据一些植发专家介绍，这种笔有明显的优点和缺点。优点是存活率高，出血少，毛囊损害率低。缺点是手术过程比较繁琐，需要增加医生和工作人员的训练时间，所以植发成本也会增加。而且针孔直径比较大、需要把供体区的头发剪得很短。
一些医生发现，跟其他种族的患者相比，亚洲人更适合用这种植发笔。因为亚洲人的毛干直径比较粗，而且是直的，比其它种族弯曲的头发更适合用这种装置。
Lion Implanter
Lion Implanter是Choi Implanter的升级版，和Choi Implanter使用空心的针头，但是升级改造后的植发笔更容易操作而且减少毛囊损伤。Lion Implanter更换针头更方便，减少了人员的操作时间。而且针头更锋利，光滑的合金材质，会减少植入过程中对头皮的拉伤和创伤。
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